稻瘟净主要用于防治稻瘟病。以40%稻瘟净乳油对水500~800倍喷雾，防治苗瘟和叶瘟，在发病初期施药，隔7天左右再施一次。防治穗颈瘟，在始穗期和齐穗期各施药一次。此浓度药液也可以防治水稻小粒菌核病、纹枯病、云形病等，以及玉米大小斑病，谷瘟病。宜在发病初期喷药。施药浓度高时，籼稻易生药害。日本和中国都曾反映过稻瘟净的稻米有异臭，称为“异臭米”，因此使用受到很大限制。日本开发异稻瘟净后，此药剂即停止使用。不宜与碱性农药、磷胺、亚胺硫磷、二氯酚钠、敌稗等混用。与乐果、马拉硫磷等有机磷杀虫剂混用，防治水稻叶蝉、飞虱有明显的增效作用.