多菌灵广泛用于大田作物、蔬菜、果树和经济作物病害的防治。以250~500毫克/升浓度喷洒，防治麦类赤霉病、水稻稻瘟病、纹枯病和小粒菌核病、油菜菌和番茄早疫病；以500~1000毫克/升浓度喷洒黑星病、桃疮痂病、苹果褐斑病、葡萄白腐病、黑事业炭疽病及花卉的某些病害，通常均能达到》80%的防治效果。拌种或浸种或浸种防治麦类黑穗病，棉花苗期病害花生立枯病、茎腐病、根腐病，以及以50毫克/升药液浸种薯防治甘薯黑斑病，均取得良好的防治效果。可与铜制剂以外的多种杀菌剂混用。多菌灵单一制剂长期连续使用，会使病原菌产生抗药性，与苯菌灵等苯并咪唑类杀菌剂有交互抗药性，其加工制剂有10%、25%和50%的可湿性粉剂，以及40%的胶悬剂。