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4-苄基吗啉-2-甲腈用作医药、化工中间体。吗啉化合物广泛存在于天然产物中,具有很强的生物活性,是许多药物的药效团。对合成的吗啉衍生物进行的生物活性检测结果表明,这类衍生物具有降低胆固醇、抗高血脂、治疗动脉硬化以及消炎等药理活性。