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3-甲氧基-1-丙醇可作为有机合成的中间体,医药化学试剂,可应用于药物分子以及生物活性分子的修饰和衍生化,例如3-甲氧基-1-丙醇可用于药物分子雷贝拉唑的合成,雷贝拉唑(Rabeprazole)适用于消化性溃疡、反流性食管炎及卓-艾综合征,对基础胃酸和由刺激引起的胃酸分泌均有抑制作用。