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2-氨基吡啶-3-甲酸甲酯可以用作医药中间体与有机合成中间体,在合成转化中,2-氨基吡啶-3-甲酸甲酯可以在碱性条件下进行溴化反应在吡啶的5号位引入一个溴原子,还可以在硝化的反应条件下在吡啶的5号位引入一个硝基基团。酯基基团可以在还原剂的作用下变成羟基基团,吡啶上的氮原子可以在氧化剂的作用下变成氮氧化物。